Спустя год в Бри-Конт-Робер открылся сельскохозяйственный филиал института под руководством С.Н. Виноградского. Пересмотрев свои исследования и работы других ученых, Виноградский пришел к выводу, что микробиологический состав почвы и деятельность микроорганизмов нужно изучать как единую и целостную систему. Научный мир всколыхнула волна открытий. Методы исследования почвы, предложенные Виноградским, позволили обнаружить виды бактерий, способных усваивать азот из воздуха, что особенно важно при выращивании растений. Последовательно Виноградский изучал функции почвенных микроорганизмов. Им исследованы не только азотфиксирующие бактерии, но и микроорганизмы, разлагающие целлюлозу. Научные открытия Виноградского положили начало целому направлению в естествознании. Он является основателем почвенной микробиологии.
В Бри-Конт-Робер Виноградский жил уединенно, в отрыве от научного мира, с которым он поддерживал связь через институт Пастера. Замкнутый, сдержанный в общении, Сергей Николаевич открывал свои чувства только людям, которых считал своими друзьями. Их было немного. Среди них — выдающиеся ученые: академик В.Л. Омелянский, нобелевский лауреат микробиолог
З.А. Ваксман, эпидемиолог академик Д.К. Заболотный.